Второй сезон состоит из 22 серий, которые выходили в эфир с 28 сентября 2006 года в 21:00, по 17 мая 2007 года.
Братья Винчестеры продолжают охотиться на демона, убившего их маму, им помогают другие охотники Эллен, Джо и Эш. Вместе с отцом они смогли раздобыть кольт (практически единственное оружие, из которого можно убить Азазеля), его создатель Генри Кольт отлил 12 пуль, но Винчестеры нашли его с шестью пулями. В серии, когда они захватили кольт, им пришлось потратить все пули, кроме одной, а Дин впадает в кому и чуть не умирает, но его отец отдает кольт и душу в обмен на его выздоровление. После смерти отца братья узнают, что Азазель хочет открыть врата ада и выпустить оттуда всех демонов, но для этого ему нужен был кольт, а теперь он у него есть. Сэм и Дин частично выясняют, в чём заключается план желтоглазого демона насчет Сэма и детей вроде него, а также, как они получили способности, которыми обладают.
Азазель открывает врата в ад, и сотни демонов вырываются на свободу, но братьям удается сразу же их закрыть. Желтоглазого демона убивают из кольта, который Винчестерам удалось перехватить во время открытия врат. Несмотря на это, Винчестеры отправляются на расправу с демонами, вырвавшимися на свободу

Третий сезон состоит из 16 серий, которые выходили в эфир в США в 21:00 с 4 октября 2007 по 17 мая 2008 года.
Со злейшим врагом рода человеческого и семьи Винчестеров в частности — Азазелем покончено. Но врата ада были некоторое время открыты и шоу под названием «Апокалипсис» уже началось — сотни демонов вырвались на свободу, над миром нависла серьёзная угроза. И снова у братьев Винчестеров полно работы. А время неумолимо бежит вперед, отсчитывая 366 дней, оставшихся у Дина после сделки с демоном перекрёстка, вернувшей к жизни его брата. На пути им встречается некая Бэла Талбот, которая находит «уникальные вещи для избранной клиентуры», занимается жульничеством, продавая поддельные амулеты и проводя спиритические сеансы. Белла сказала Дину, какой из демонов владеет всеми сделками. Дин и Сэм, вместе с Руби ищут этого демона, чтобы спасти Дина. Но им этого не удается, и Дина разрывают адские псы Лилит, а его душа попадает в ад.

Четвёртый сезон состоит из 22 серий, которые выходили в эфир в США с 18 сентября 2008 по 14 мая 2009 года в 21:00 по четвергам.
18 сентября 2008 года Дин неожиданно возвращается из ада. Отыскав Бобби и Сэма, Дин принимается искать существо, воскресившего его, но оказалось, что ни один демон не способен на такое. На протяжении всего сезона, братья Винчестеры стараются предотвратить взлом 66 печатей, которые взламывает Лилит, чтобы Люцифер восстал из ада и устроил апокалипсис.

Сломана последняя печать, Люцифер свободен и готовится свершить Армагеддон. В этом ему активно помогают Всадники Апокалипсиса. Не бывать концу света без схватки двух архангелов — Михаила и Люцифера. Но устроить битву во имя рая на Земле архангелы не могут, не имея орудий своих. Меч Михаила утерян, его главное оружие на Земле и он должен отыскать его, прежде чем заточить Люцифера назад в клетку. Битва Михаила и Люцифера на Земле погубит более, чем половину планеты и её населения, Винчестеры ни за что не допустят это. Им удаётся найти другой, более безопасный для планеты способ расправиться с Люцифером.

Прошёл год с тех пор как Сэм прыгнул в клетку с Люцифером. Дин пытается жить обычной жизнью с Лизой и её сыном, забыв про охоту. Но неожиданно появляются Джины, желающие отомстить за потерю сородича. Они отравляют Дина, но от смерти его спасает Сэм… Дин узнаёт, что Сэм и его дедушка непонятным образом воскресли год назад и с тех пор занимаются охотой на нечисть. Присоединившись к их отряду, Дин замечает некоторые странности в поведении Сэма. С помощью Кастиэля он узнаёт, что у Сэма отсутствует душа — она всё ещё заперта в клетке с Люцифером и Михаилом. Вскоре становится известно, что Сэма воскресил демон Кроули, который после исчезновения Люцифера стал главным в аду. Шантажируя их душой Сэма, он заставляет братьев ловить для него всевозможную нечисть, чтобы выведать, где находится чистилище. Но им это быстро надоедает, и они, заручившись помощью Кастиэля, проникают в логово Кроули, чтобы заставить его вернуть Сэму душу. Но тот признаётся, что не в силах это сделать. Кастиэль сжигает человеческие останки Кроули, и демон умирает. Дин использует кольцо, которое ему дала Смерть, чтобы связаться с ней. Он просит её вернуть душу его брату. Смерть требует взамен оказать ей одну услугу. Дин соглашается, но не справляется с задачей. Тем не менее, Смерть возвращает душу Сэму. Когда Сэм приходит в себя, выясняется, что он ничего не помнит с момента заточения Люцифера. Дин не находит в себе смелости рассказать брату о так называемой стене, которая не дает Сэму вспомнить что происходило с ним последние полтора года. Братья снова начинают охоту на нечисть. Но Сэм сам всё узнает от Кастиэля и решает исправить всё, что натворил за прошедший год. Отношения между братьями вновь приобретают старый тёплый характер. Но появляется другая проблема. Братья сталкиваются с новым монстром — Евой, матерью всех сверхъестественных существ. Ева намерена создать новых тварей, чтобы истребить род людской в отместку за страдания, которые причинял её детям Кроули. Винчестеры узнают, что уничтожить Еву можно только прахом Феникса. За этим редким веществом братья отправляются в прошлое, во времена Дикого Запада. Феникс — это сверхъестественное существо, воплощённое в местном бандите. В прошлом Винчестеры знакомятся с Сэмюелем Кольтом, создавшим легендарный пистолет. Позже братья убивают Феникса и с трудом добывают его прах. Дин убивает Еву, но перед смертью Мать открыла братьям правду — Кроули жив и всё также лелеет мечту открыть Чистилище, чтобы получить безграничную мощь томящихся там душ. А помогает ему в этом… Кастиэль. Мятежный ангел решил пойти на сделку с демоном, чтобы, наконец, положить конец гражданской войне на Небесах.
Дин тяжело переживает предательство Каса, но, несмотря на их дружбу решает помешать ангелу открыть Чистилище. Кроули предпринимает отчаянный шаг, чтобы задержать братьев и похищает Лизу и Бена. С помощью Кастиэля Винчестеры спасают заложников, и Дин настаивает, чтобы Кас стёр им память обо всём, что с ним связано. Лиза и Бен забывают, что когда либо были знакомы с Дином или чем-либо сверхъестественным.
Позже Кастиэль в последний раз предупреждает братьев не мешать ему в осуществлении своего плана. Когда они отказываются, Кас решает разрушить стену в памяти Сэма. Это приводит к тому, что Сэм впадает в кому и его сознание распадается. Чтобы вернуться в реальность ему нужно найти и вернуть свои воспоминания. Для этого ему придётся столкнуться с самим собой бездушным и с самим собой, помнящим Ад. Одолев свои тёмные стороны, Сэм находит силы очнуться.
В день лунного затмения, когда Кастиэль и Кроули задумали открыть Чистилище, Кастиэль внезапно меняет условия сделки и предлагает Кроули либо бежать, либо умереть. Кроули сбегает, но приходит с подмогой в лице демонов и Рафаила. Вовремя подходят Винчестеры и Бобби. Кас уходит, а Кроули проводит обряд открытия Чистилища. Ничего не происходит. Снова приходит Кастиэль. Оказалось, что он подменил ингредиенты для ритуала, и пока Кроули совершал ложный ритуал, сам открыл Чистилище и забрал себе все души. Кастиэль, ослепленный новой властью и силой, стал считать себя новым богом. Винчестеры пытаются убедить Каса, что такая мощь больше ангелу не нужна. Но Кастиэль не согласен, и он больше не ангел. Теперь он уверен, что он Бог и люди должны ему подчиняться, в противном случае он уничтожит всех.

Первая серия нового сезона повествует о том, что Кастиэль всё же не Бог, а как выразился Смерть: «всего лишь ангел-мутант». Дин и Сэм помогают Кастиэлю избавиться от большинства душ, которые рвут его тело на части. Но серия заканчивается тем, что самые ужасные создания овладевают Кастиэлем. Эти самые ужасные создания — левиафаны, которых Господь создал задолго до ангелов и людей. Вскоре Левиафаны понимают, что тело обычного радиоведущего не способно вынести в себе тысячу тварей. Кастиэль погибает, а Левиафаны уплывают в разные концы планеты, растворяясь в водных ресурсах. Левиафаны через воду вселяются в тела людей и облюбовывают одну из клиник. Сэма начинают преследовать видения Люцифера, в которых тот убеждает Сэма, что все что окружает Сэма — иллюзия, а в действительности тот все ещё в клетке с Люцифером. Дин переживает за брата, понимая, что за видимым спокойствием Сэма скрывается мучительная пытка разума. В ходе охоты Сэм наталкивается на случай, тесно связанный с произошедшим многие годы назад. Дину приходится принимать непростое решение. В четвёртой серии братья встречаются с египетским богом Осирисом, который устраивает суд для Дина, взвешивая его «промахи» (погибшие невинные) и «добрые дела» (спасенные души). Все бы ничего, если бы не вечное «самопожирание» Дина и огромное чувство вины. Главный «туз» Осириса скрывался в монстре, которого Дин убил серией раньше. Этот монстр — бывшая подружка Сэма. После встречи с ней через десять лет после знакомства она заверяет Сэма, что убивает лишь для своего ребёнка и, когда тот вылечится, она прекратит это дело. Брат просит Дина не убивать её, «если ты не веришь ей, поверь хотя бы мне». Поначалу кажется, что Дин доверился брату. Но в конце серии мы убеждаемся в том, что охотник не изменяет своим правилам, убивая монстра. Уходя из квартиры после убийства, он сталкивается с сыном покойной, который клянется первому, что отплатит ему, как только подрастет. Следующее дело братьев связанно с конфликтующей супружеской парой. Все бы ничего, но от ссоры ведьмака и ведьмы добра не жди. Выпутавшись из непростой ситуации, Винчестеры сталкиваются с охотившимся за ними Левиафаном. Но от верной смерти их спасает вышеупомянутый ведьмак, парализуя монстра заклятием на несколько суток. Другие же Левиафаны примеряли на себя облик братьев и хладнокровно расстреливают людей во всех городах, где были братья, при этом показывая свое(то есть Дина и Сэма) лицо в каждую камеру. Вся Америка ищет братьев, а тем временем Бобби с помощью шерифа Миллз наконец-то находит способ остановить Левиафанов. Братья убивают своих двойников, но перед смертью лже-Дин рассказывает Сэму, что Дин, несмотря на просьбу брата, убил его подружку-монстра. Сэм, высказавшись, уходит от брата. Тем временем Кроули попытался заручиться поддержкой Левиафанов, однако, получив отказ, исчез. Позже Бобби погибает от рук главного Левиафана, становясь призраком (о чём братьям не известно до 7 сезона 19 серии). Он не хочет отправляться в загробный мир, и поэтому сбегает от жнеца, пришедшего за ним, и начинает помогать братьям. Сэм из-за своих галлюцинаций, вызванных Люцифером, попадает в психушку, и Дин в отчаянии. Со стола падает книга, и оттуда выпадает визитная карточка парня, который может помочь избавиться от видений в голове Сэма (книга падает не случайно, её скидывает призрак Бобби, чтобы помочь парням). Позвонив по номеру на визитке, Дин узнает, что этот парень знает чудного лекаря, который исцеляет все прикосновением. Придя к этому целителю, Дин видит Кастиэля. Он потерял память и не знает, кто он. Дин уговаривает его поехать в больницу, где Кастиэль вспоминает кто он, и что он натворил. Чтобы искупить свою вину, он берет «болезнь» Сэма на себя, оставаясь в психбольнице. Сэм же выздоровел. Братья продолжают охоту на Левиафанов. В 7 сезоне 19 серии они узнают, что Бобби призрак и он убежал от своего жнеца, от этого злится Дин. Он говорит, что все должно идти своим чередом. В следующей серии братьям приходит письмо от Фрэнка, в котором говорится, что Фрэнк мертв и кто-то пытается взломать жесткий диск с его компьютера. Братья отслеживают его местонахождение и с помощью девушки-хакера воруют у Дика Романа некий чемодан. Бобби останавливает Дика в погоне за братьями. В чемодане оказывается Слово Господне, за которым приходит новоиспеченный пророк и расшифровывает надпись на нём. Теперь Винчестеры знают, как убить левиафана. Для этого нужна кость праведника, омытая кровью трех падших. Ангелы доставляют пророка домой, где их без труда убивает ближайший друг Дика Романа. В заключительной серии седьмого сезона братьям удается создать оружие и победить Дика, но убив его, Дин и Кастиэль пропадают. Появляется Кроули, который заявляет, что убийство Дика было частью его плана. Сэм спрашивает его, где Дин, на что Кроули отвечает, что использование такого оружия имеет побочный эффект. Сезон заканчивается тем, что Дин и Кастиэль оказываются в Чистилище, где каждая душа — чудовище. Кастиэль пропадает, а Дин остаётся один, чудовища окружают его.

Осенью 2012 года CW вновь выпустил Сверхъестественное в восьмом сезоне. Сэра Гэмбл ушла в отставку с поста исполнительного продюсера. Джереми Карвер занял её место на восьмом сезоне. Сезон выходит в эфир по средам. Режиссёром 3 серии 8 сезона стал Дженсен Эклс, исполняющий роль Дина Винчестера.
После года заточения в Чистилище, Дин возвращается на Землю без Кастиэля, принеся с собой внутри своего тела вампира Бенни. В течение этого года Сэм перестал охотиться и начал встречаться с ветеринаром по имени Амелия. К возвращению Дина они уже расстаются. Дин втайне помогает Бенни овладеть своим телом и воссоединяется с Сэмом. Вместе они узнают, что пророк Кевин спасся от Кроули. Кевин рассказывает им, что Кроули нашёл ещё одну скрижаль со Словом Божьим, которое содержит заклинание, способное навеки закрыть Врата Ада и заточить всех демонов внутри. Ко всему прочему, заклинание способно и на противоположное: открыть врата и вышвырнуть всех демонов наружу, на Землю, что и хочет Кроули. Кевин также говорит, что он украл скрижаль, заставив Кроули преследовать его и в процессе убить его девушку. Мать Кевина присоединяется к путешествию своего сына. Сэм выявляет сущность Бенни, вследствие чего два брата ссорятся. Тем временем Кастиэль загадочным образом возвращается из Чистилища. Кроули снова ловит Кевина и пытает его, заставляя рассказать ему о других скрижалях, но Кастиэль спасает его. Позже Винчестеры и Кастиэль спасают ангела по имени Самадриэль, но незадолго до этого он, под пыткой, рассказывает, что есть ангельская скрижаль, которая может нанести большущий вред, если попадет в плохие руки. Винчестеры также узнают, что они наследники Хранителей Знаний, секретного общества, которое хранило и архивировало сверхъестественные знания, и вступают во владения хранилища этих знаний, которое находится в их родном штате Канзас. Сэм и Дин узнают, что для закрытия Врат Ада нужно пройти три испытания, два из которых (1. Искупаться в крови адского пса; 2. Спасти невинную душу из Ада и доставить её в Рай) Сэму удается пройти, до того как Кроули снова не заполучает Кевина и его заметки по демонской скрижали, которую он спрятал из-за паранойи. Винчестеры и Кастиэль находят ангельскую скрижаль с помощью Мэг, но её убивают, а Кастиэль сбегает со скрижалью, чтобы защитить её ото всех, даже от самих братьев. В дальнейшем Винчестеры находят ангела Метатрона, писца Слова Божьего, а также вторую часть демонской скрижали, которая содержит третье испытание — вылечить демона.
Сезон содержит два флэшбека, параллельных главной теме: отношения Сэма с Амелией и время, проведенное Дином в Чистилище. Выясняется, что Кастиэль, заточенный в Чистилище вместе с Дином выжил и избежал сумасшествия. Но в последний момент, когда они вдвоем уже должны были высвободиться оттуда, Кастиэль решает остаться, в качестве наказания за свои грехи. Кастиэль, втайне от Винчестеров, узнает, что он был возвращен на Землю группой ангелов, возглавляемых высокопоставленным ангелом по имени Наоми, которая контролирует его. Наоми говорит ему, что он не будет помнить ни одну из их встреч и будет периодически докладывать ей о действиях Винчестеров. Контроль над Кастиэлем оказывается сильным, вплоть до убийства им другого ангела. В дальнейшем контроль над Кастиэлем разрушается с помощью ангельской скрижали, и Наоми вербует себя в помощь Винчестерам, показывая себя как их союзник. Тем временем Метатрон пытается уговорить Кастиэля закрыть врата рая, Кастиэль соглашается и проходит первые 2 испытания, первое: убить нифилима-то есть потомка ангела и человека, второе: забрать стрелу Купидона. В финальной серии восьмого сезона Винчестеры проходят третье испытание, и они решаются на сделку с Кроули, но на самом деле лишь притворились, тем самым схватив демона в наручники с демонской ловушкой. Они пытаются вылечить демона превратив его в человека как было показано в старых видео просвещённых. Но вдруг появляется Кас и просит помочь Дина закрыть врата рая, потому что Метатрона забрала Наоми. Сэм уговаривает Дина помочь Кастиэлю, а сам в течение 8 часов пытается вылечить Кроули. Наоми говорила им, что она их союзник и, что Метатрон лжёт и пытается отомстить. И также она сказала, что если Сэм закончит испытания он умрёт. Дин немедленно направляется к Сэму спасая его. А тем временем Метатрон забирает Благодать Кастиэля, проходя третье испытание. Последние кадры показывают падение всех ангелов с Небес на Землю.

После испытаний, Сэм впал в кому. Дин сделал всё, чтобы восстановить его. И, когда понял, что всё тщетно, возвал ко всем ангела и заявил, что Сэму плохо, он умирает. И он, Дин Винчестер, готов принять помощь любого ангела. В итоге к нему пришёл ангел, представившейся ему Иезекиилем. После осмотра Сэма ангел заявил, что слишком слаб и сможет излечить Сэма только изнутри. Ангел обманом вселяется в тело Сэма, стирает ему воспоминания о происходящем. В это время Кастиэль, лишённый благодати, попадает на землю. Гарт, охотник и бывший помощник Дина, становится вервольфом. Кастиэль снова становится ангелом, забрав благодать у другого ангела. Сэму становится значительно лучше, но потом выясняется, что в Сэме находится вовсе не Иезекиил, а падший ангел Гадриэль, который в далёком прошлом впустил в рай Люцифера и из-за этого был заточён на 700 лет в небесную тюрьму. Дин с помощью печати, пытается поговорить с Сэмом, но ангел изменил печать и смог сбежать, убив пророка Кевина по заказу Метатрона. Кроули, Дин и Кастиэль изгоняют Гадриэля и тот возвращается в своё прежнее тело. В 15 эпизоде Дин и Сэм вновь встречаются с Укротителями духов, и начинают охоту на Тонкого человека. Кроули начинает сотрудничать с Дином, дабы найти Первый клинок и убить рыцаря ада Аббадон. Они находят Каина и тот передаёт Дину свою печать, говоря, что без печати от клинка нет пользы. Сам же клинок они находят у бывшего хранителя знаний. Дин убивает Аббадон и понимает, что испытывает тягу к убийству. Кастиэль становится предводителем армии ангелов. Ангелы говорят Кастиэлю, чтобы он убил Дина, за то что тот убил Тессу, но он отказывается. В итоге, группа Каса присоединяется к Метатрону. Гадриэль переходит на сторону Винчестеров и Кастиэля.
В последнем эпизоде Дин проигрывает схватку с Метатроном, который изображает Мессию на Земле и называет себя Марфом. Кастиэль попадает на Небеса и разбивает ангельскую скрижаль. В это время Метатрон пронзает грудь Дина ангельским клинком, и тот умирает. Сам Метатрон возвращается в Рай, где Кастиэль и ангелы хватают его и заточают в Небесную тюрьму. Сэм доставляет тело брата в бункер Хранителей Знаний и укладывает на кровать, а сам спускается в подвал, где пытается вызвать Кроули. В это время Король Ада уже находится рядом с телом Дина. Он рассказывает неподвижно лежащему Винчестеру о том, что Каин, не в силах противостоять силе метки, решился на самоубийство… Но метка не отпустила его — Каин восстал в виде Рыцаря-Демона. В конце эпизода Дин открывает глаза и зритель видит в них Тьму — охотник стал демоном.

Сериал официально продлен на 10 сезон. Премьера состоится 7 октябре 2014 года.